A Semmelweis Egyetem egyetemi tanára, a Genetikai-, Sejt és Immunbiológiai Intézet igazgatója, az MTA rendes tagja. Fő kutatási területe az immungenomika. Ujabban az epigenetikai szabályozás (CpG metiláció, hisztonacetiláció) valamint mikro RNS-ek génhálózati szinkronizációs mechanizmusa felé fordult a figyelme. Kilenc tudományos könyvet írt és szerkesztett, ezek többek között a Springer, Karger, John Wiley & Sons és a Landes kiadó gondozásában jelentek meg. Több mint 300 tudományos publikációjára mintegy 3500 idézetet kapott, kumulatív impakt faktora kb. 750, H indexe: 30. Korábban a Magyar Immunológiai Társaság és az MTA Immunológiai Bizottságának elnöke volt. Külföldi tanulmányútjai során dolgozott a dániai Odense Egyetemen (1980-81), a bostoni Harvard Orvosegyetemen (1984-86) és az Osakai Egyetemen (1989).
Dr. Falus András rendezte az első Immungenetikai Világkongresszust (2004) és az első Nemzetközi Immuninformatikai (Immunomikai) konferenciát (2006) is. Alapító tagja a Nemzetközi Immunomikai Társaságnak. Tagja, szerkesztője számos nemzetközi tudományos folyóirat szerkesztőbizottságának.
Harmincnál több PhD hallgató írta meg disszertációját irányítása alatt.
Dr. Falus András Széchenyi díjban (2006), Neumann díjban (2006) és Semmelweis díjban (2008) részesült.